Будущее. На Марсе, в районе Ацидалийской долины высаживается земная экспедиция. Внезапно начинается сильная буря, автронавты решают экстренно покинуть планету. Буря отрывает элемент спутниковой антенны и он сбивает с ног одного из членов экспедиции, ботаника Марка Уотни. Скафандры астронавтов снабжены биомониторами, но монитор Марка оказывается поврежден. Руководитель миссии считаем Марка погибшим. Экипаж улетает. Марк остается на Марсе в одиночестве. Марсианин.

Астронавт остаётся один на планете, раненый, без связи с Землёй (антенна и корабль уже недоступны), в жилом модуле с ресурсами на месяц для группы из шести человек. Марк рассчитывает, что ему нужно передать сигнал на Землю и выжить в течение трёх лет до следующей миссии Ares IV. Для пополнения запасов пропитания Марк использует несколько имевшихся клубней картофеля, припасённых для праздничного ужина к Дню благодарения, разбивает делянку (для этого он насыпал внутрь модуля марсианский грунт, затем добавил органику, добытую из накопившихся отходов жизнедеятельности, в качестве удобрения) и начинает выращивать картофель. Для получения воды Марк проводит химическую реакцию, используя оставшееся в баках посадочной ступени улетевшего корабля ракетное топливо — гидразин.

На Земле спустя почти 2 месяца после эвакуации специалисты NASA, анализируя спутниковые фотографии, выдвигают предположение, что Уотни выжил. На Марсе Уотни находит не функционирующий с 1997 года аппарат Mars Pathfinder. Он использует передатчик аппарата, чтобы отправить данные на Землю. NASA правильно угадывает его намерения и возрождает программу аппарата, за которым уже давно никто не следит. Установив связь, специалисты начинают расчёт по следующей пилотируемой миссии Ares IV с учётом операции спасения, но подготовка займёт долгое время. Астронавту хотят выслать грузовой корабль с оборудованием и запасами для выживания. Подготовка запуска в сжатые сроки без проверок заканчивается катастрофой: взрывом во время старта. Помогают китайские коллеги, запуская зонд на своём носителе. На поверхности планеты Марк делает ошибку, пользуясь только одним шлюзом жилого модуля. Надувные стенки шлюза износились и однажды происходит взрывная разгерметизация жилища Марка — картофельная ферма погибает.

Тем временем экипаж Ares III летит домой, но на Земле считают, что экипажу лучше не знать, что Марк выжил. Но тем не менее команда узнаёт правду и негласно получает расчёты того, что, совершив гравитационный маневр у Земли, они теоретически могут вернуться к Марсу. Льюис и экипаж решают взломать компьютеры корабля, чтобы центр управления их не остановил, и вернуться на выручку товарища. Они готовы провести в космосе ещё 533 дня. Перехватив по дороге китайский зонд, астронавты летят к Марсу. Проходит семь месяцев. Уотни, узнав о возвращении Ares III, готовится к отбытию.

Проведя на планете 461 сол, Марк выдвигается на марсоходе к кратеру Скиапарелли, на расстояние в 3200 км, туда, где находится стартовый модуль для будущего отбытия экипажа Ares IV. Максимально облегчив модуль, астронавт улетает с поверхности Марса. Ему не удаётся набрать достаточную высоту, и команде Ares III приходится пойти на авантюру с торможением корабля на орбите реактивной струей бортового воздуха, но и после уравнивания скоростей Уотни всё ещё недосягаем для спасения. Тогда он импровизирует, делая прокол в перчатке скафандра, и успешно возвращается на Hermes, а затем — на Землю.
Дома Марк Уотни становится инструктором по выживанию в сложных условиях для будущих астронавтов.

К Марсу отправляется новая экспедиция «Ares V», рассчитанная на более чем 400 дней. Все члены экипажа «Ares III», кроме Мартинеса, наблюдают за стартом по телевизору. Мартинес — на борту корабля, отправляется в новый полет.